GC/MS上的未知物鉴定主要依靠谱库检索（如NIST、Wiley等谱库），但检索给出的候选结果只是列出来与样品EI-MS谱图相似的可能候选化合物，当匹配度打分高的情况下，比如正、反检索匹配度都≥850，或者更高，那么候选化合物的正确性就高。

　　不过经验告诉我们，匹配度高，并不代表它一定正确，需要其它信息用于辅助，在GC/MS上GC保留指数RI是一个重要的辅助未知物鉴定的指标，它能很好地验证谱库候选结果的合理性，比如区分配度接近的同分异构体、同系物等。

　　遗憾的是，目前不管是用NIST、Wiley谱库，或者一些专业谱库，如香精香料谱库，它们中收录的化合物，并不是全部都有记录保留指数RI的信息。

　　在之前的“在天然产物、香精香料、食品风味及环境分析等领域中，如何借助 GC/MS对谱库中未收录的完全未知物质进行准确鉴定？”一文中，我们提到了利用Cerno Bioscience 公司开发基于网络的应用程序AIRI，预测所有可能结构的保留指数。

　　下文将以MassWorks软件的AIRI功能预测保留指数对谱库检索的候选化合物进行辅助确认。

　　如图1所示，未知峰51.673min，使用GC-Analyzer香精香料谱库检索得到一个匹配度打分很高的候选化合物：ethyl 3-(2-hydroxycyclohexyl)propionate (CAS # 94088-21-8)，其正检索匹配度为96，反检索匹配度为96，可能性为97%（见图2）。

图1：未知峰Rt=51.671min及其质谱图

图2：GC-Analzyer香精香料谱库检索匹配结果

　　尽管谱库检索的匹配度已经非常高，但是为了确认其是否正确，我们还是期望使用保留指数进行确认，但谱库并没有记录该疑似化合物的保留指数信息，我们在Pubchem和ChemSpider网络数据库也检索到了该化合物，但也没有查询到保留指数信息。

　　1. 测定未知峰的保留指数RI

　　我们直接使用51.673min未知峰前后临近的已经得到鉴定的峰的保留指数校正计算它的保留指数。保留指数的计算在GC-Analyzer软件中完成，最后确定出该未知峰的保留指数RI= 1547。

图3：51.673min未知峰的保留指数

　　2. AIRI预测未知峰的保留指数

　　我们将疑似物ethyl 3-(2-hydroxycyclohexyl)propionate 的结构式导入MassWorks的AIRI模型预测其保留指数，得到AIRI保留指数为1552.9，如图4所示。

　　对比测定的保留指数1547，与AIRI的偏差为5.9，这一结果基本证明该化合物是正确的匹配，当然最终还需要通过进样标准品来验证。

图4：MassWorks AIRI预测结构式的保留指数

图5：RI测定值与AIRI值

　　3. 小结：

　　但谱库检索无法提供候选化合物保留指数信息，我们可以使用AIRI预测保留指数来筛选未知化合物潜在候选物。

　　AIRI提高了筛选未知化合物潜在候选物的准确性，特别是当同时出现多个高匹配候选时，AIRI能最大限度地缩小潜在化合物的范围，方便我们购买或获取更少数量的标准品用于验证。

　　为了保证结果的正确性，最终的化合物鉴定还是需要通过合成化合物来进行确证。

　　关于MassWorks 软件

　　MassWorks软件是由 Cerno Bioscience 公司开发的一款革命性的MS数据定性分析软件，能帮助我们在低分辨率的四极杆GC/MS、LC/MS直接测定化合物的精确质量，并通过独有的谱图准确度概念确定出准确的分子式。MassWorks软件同样适用于高分率质谱（TOF、Orbitrap）的定性分析。