GC/MS上未知物的精确质量及分子式测定用于可能结构式的推测
GC/MS是定性分析挥发性有机物的最常用、且最方便手段。在NIST、Wiley等数据库的帮助下,我们可以轻松对GC/MS采集的未知物谱图进行搜库,以确定可能的疑似物,然后再通过标准品对照来最终定性。但如果质谱谱库或数据库本身没有收录的化合物——完全未知物,那要怎么来对未知物进行推断呢?
今天分享一个食品风味分析的案例,使用MassWorks软件直接在低分辨四极杆GC/MS对未知物的精确质量及分子式测定,并上尝试对未知物的结构进行推测。
GC/MS上的未知物
如图1所示,未知峰33.47min,提取的质谱图在NIST20谱库中匹配度不佳,排名第一的候选结果其正/反检索匹配值分别为665和767,这提示该组分在NIST中没有收录。

图1:33.47min处的未知峰及其质谱图(Pforile模式下采集)
我们将采集的轮廓图Profile数据在MassWorks中打开,用PFTBA的标准离子进行精确质量和峰型校正,并将校正结果用于该样品数据,以获得该未知峰的精确质量(图1下)。
1. GC/MS结合MassWorks软件测定精确分子量/分子式
观察该质谱图,我们发现没有明显的分子离子峰,质量最大的离子为m/z 159,结合其它可见碎片离子的质量数和氮规则,我们可以判断的是该未知物的分子量应为160,且不含N元素。图2显示了碎片离子[M-H] m/z 159的精确质量及分子式测定结果,其质量偏差为-11.27mDa,化学式为C8H15O3,同位素谱图准确度为99.24%,因为得到真正的分子离子的分子式为C8H16O3。

图2:离子m/z 159的精确质量及分子式测定结果
2. 其它主要碎片离的精确分子量/分子式
其它碎片离子的精确质量和分子式参考m/z 159的处理方式,结果如表1。
表1:主要离子的精确质量及分子式测定结果

备注:m/z 85-87,m/z 69-73为两组碎片离子簇,精确质量只考虑了最小的离子,谱图准确度为离子簇的混合打分。

图3:离子簇m/z 69-73的分子式测定结果
3. 结构式推导
结合表1的数据结果,我们可以得出如下结果:
1)分子可直接裂解为m/z 103(C4H7O3)和m/z 57(C4H9),结构是明确由C4H7O3-C4H9构成;质谱图没有发现丢失-CH3、-CH3H2的碎片,考虑到碎裂的稳定,C4H9为支链丁烷基的可能最大,故而结构式可能由C4H7O3-CH2CH(CH3)2构成。
2)质谱图上仅次于m/z 159的第二高的质量为m/z 143,可以判断其为M-OH产生;同时m/z 129(C7H13O2)的存在,表明其碎裂路径为M-OH-CH2,故而结构式可进一步拆解为HO-CH2-C3H4O2-CH2CH(CH3)2;
3)m/z 72 (C3H4O2)前存在一系列-H离子簇的存在,这意味着该基团不太可能存在C=O键,而分子式C8H16O3的不饱和度为1,故而存在含O杂环的可能性极大,最大可能性为CH-CH2-O-CH-O;
4)我们将m/z 160的分子式C8H16O3在Pubchem中进行查询,找到了一个符合上述推测的可能结构式,见图4,当然最终的结果还需要借助标准品或合成来进行验证。

图4:符合推测设想的疑似结构
4. 结论
NIST等谱库没有正确的匹配时,我们可以借助精确质量测定的手段对离子的分子式进行测定,可以借助高分辨TOF,或采用本文中提到的低分辨MS结合MassWorks软件的方式。
结合碎片的离子的分子式结果,我们可以尝试对结构进行推导,需要注意的是,在没有其它信息的辅助下,质谱的结构推测并不能完全正确,有可能只是得到了接近的结构式,最终的结构确证还需要通过获得标准品或化学化成来验证,
关于MassWorks 软件
MassWorks软件是由 Cerno Bioscience 公司开发的一款革命性的MS数据定性分析软件,能帮助我们在低分辨率的四极杆GC/MS、LC/MS直接测定化合物的精确质量,并通过独有的谱图准确度概念确定出准确的分子式。MassWorks软件同样适用于高分率质谱(TOF、Orbitrap)的定性分析。
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绿绵科技是Cerno Bioscience公司在中国区的总代理商,负责Cerno公司旗下的MassWorks、GC/ID 等产品市场推广、销售、售前/售后技术支持、应用支持。
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