AIRI保留指数预测工具:在没有标准品的情况下辅助验证GC/MS未知物分析

质谱中未知化合物的精准鉴定一直是一项复杂难题。高质量准确度对未知物鉴定至关重要,而谱图准确度则提供了额外的鉴定能力,即便是在低分辨单四极杆仪器上,也可实现可靠的化合物定性。
MassWorks™软件支持通过 TrueCal™完成质量与谱图准确度校正,进而给出未知物的元素组成。在谱库(NIST、PubChem、ChemSpider 等)检索候选结构,或基于质谱碎片推导全新结构之后,研究人员通常会采购或合成对照标样,并借助核磁共振(NMR)完成结构确证。
但如果无法采购或合成对照标样,该如何处理?
AIRI 技术正是为此而生。
Cerno Bioscience公司发布的MassWorks AIRI工具可直接根据疑似化合物结构式直接预测其保留指数RI,结合实测RI数据,可以辅助完成未知物的结构鉴定,尤其是在无法获取标准的情况下,这将是一个非常有用的工具。
如此前发表的《未知物分析:在单四极杆GC/MS上鉴定谱库中未收录化合物的策略》一文所述:AIRI 依托机器学习模型,根据候选化学结构预测保留指数,为无法获得实物对照标样的场景提供了一种快速、经济的替代方案。
AIRI的原理与性能
基于PATGN 深度神经网络集成模型,输入化合物化学结构(SMILES),直接预测 Kováts 保留指数 RI,针对半极性 GC 色谱柱优化;同时输出每条预测结果的预测标准差,定量给出预测不确定度、95% 置信区间,便于判断预测结果可靠性。
性能指标:平均绝对误差 MAE=15.1;95% 分位绝对误差 46.5,预测精度优于很多传统 RI 预测算法。
需要注意的是:① AIRI的模型主要针对半极性色谱柱;② AIRI 给出是预测 RI,不是实测 RI;输出附带不确定度,必须结合质谱(元素组成、碎片、谱图准确度)综合判断,不能单独作为最终定性证据;③ 最终确凿结构确证,依然优先建议 NMR 或者实物标准品验证。
引入 AIRI 之后GC/MS未知物鉴定流程:① 质谱推分子式(MassWorks+低分辨GC/MS测定精确质量和分子式,或高分辨质谱测定精确质量和分子式)→ ② 结合碎片离子分子式和碎裂途径,生成候选结构;或谱库(NIST、PubChem、ChemSpider 等)检索候选结构 → ③AIRI 预测 RI 与实测 RI 比对,预先筛选候选,跳过标样采购合成环节做初判 → ④ 只对高置信候选再做标样合成或 NMR 确认。
AIRI的的操作与结果输出
MassWorks AIRI工具的使用非常简单,我们只需要输入待预测保留指数的化合物的SMILES结构式即可(如图1所示),单次最多可输入25个化合物的SMILES结构式,然后点击“Predict Retention index”,几秒钟后即可返回保留指数预测结果。

图1:AIRI中输入待测化合物的SMILES结构式
最终的AIRI预测保留指数将呈现在结果表中。

图2:AIRI保留指数预测结果表
AIRI的应用场景
AIRI与 MassWorks 联用,解决单四极杆 GC‑MS 最难的痛点:谱库中不存在、无商用对照标样的 “未知‑未知” 化合物定性。它利用机器学习从候选结构预测 Kováts 保留指数,把色谱保留行为作为独立正交证据,和元素组成、谱图准确度联合打分筛选候选结构,大幅减少标样合成 / 采购需求,缩短分析周期、降低成本。
1)谱库不存在的未知物鉴定(Unknown‑Unknown)
GC‑MS 检测出的峰在 NIST 等标准谱库没有匹配条目,是 AIRI 最核心用途,尤其适合单四极杆低分辨 GC‑MS 仪器,普通单四极杆原本很难做谱库外未知物。
2)无法获取实物标准品的项目
待测物标样商业化不可得、合成难度高、成本昂贵、有毒高危,无法购买或合成参考标准品,用 AIRI 预测 RI 做交叉验证,省去标样制备环节,缩短周期、降低实验成本。
3)复杂基质、异构体区分
多个候选结构有相似质谱碎片,仅靠谱库检索无法区分;AIRI 预测 RI 提供色谱保留行为的独立判据,辅助筛选排除错误候选结构。
4)环境、食品、消费品、药物研发领域
环境污染物筛查、食品中非预期杂质、药物杂质、代谢物;很多杂质没有商用标样,结合 MassWorks 谱图准确度 + AIRI 预测 RI,完成初步结构推定。
5)谱库数据增强
为 NIST EI‑MS 库中大量缺少实测 RI 的化合物批量补充 AI 预测 RI 值,提升谱库检索能力。
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